一、蜂蜜产量低
蜂蜜是蜜蜂养殖最主要的产品，实际上很多养蜂人通过销售蜂蜜来获得效益的，但蜂蜜的产量因蜂种不同有很大的差异，例如中蜂定点养殖的时候，一群蜂每年只能生产10斤左右的蜂蜜，极少有能超过20斤的。另一个蜂场的中蜂群数也不能超过50群，否则反而会因蜜源不足降低整体的蜂蜜产量。
二、收益不稳定
蜜蜂养殖效益不稳定主要是因为蜂蜜产量不稳定。影响每年蜂蜜产量的因素主要有两个：一个是蜜源植物开花流蜜受气候影响非常大，一些蜜源植物甚至存在着明显的大小年；二是蜜蜂采集花蜜时受天气影响非常明显，比如大流蜜期遇到连续雨天则当年的蜂蜜产量也会大大降低。
三、假蜂蜜泛滥
假蜂蜜是制约养蜂最主要的因素，因为这些假蜂蜜的成本非常低（用糖浆和色素勾兑只要几元钱），所以可以以极低的价格迅速占领真蜂蜜的市场。另外，这些假蜂蜜破坏了消费者心中蜂蜜的形象，害怕买假蜂蜜而不买蜂蜜，最终真正养蜂的人因蜂蜜销售不出去而赚不到钱。
四、养殖难度大
蜜蜂养殖不仅有极高的技术门槛，还需要长期的经验积累，例如春天的繁殖是提高养蜂效益的必要前提，但只知道春天的繁殖是不够的，还需要知道当地什么时候开始春天的繁殖。另外，蜜蜂的很多疾病都有传染性，疾病防控方面做不好易导致全场蜂患病，因此养蜂不但有一定的难度且存在着风险。
