一、饲养强群
强群对巢虫有很强的抵抗能力，所以预防巢虫最好的方法是饲养强群，养蜂人必须随时保持巢脾上有足够的蜜和粉，同时一定保证蜂多于脾或蜂脾相称，这样即使蜂群受到巢虫的危害，但由于其群势强大、子脾面积大，受巢虫危害的面积相对小些，损失也不会天明显，也不会影响正常的养蜂生产。
二、淘汰旧脾
中蜂有喜新脾、厌旧脾的习性，一般情况下蜂王会优先在新脾上产卵，当巢脾过旧时工蜂就会将黑旧的老巢脾咬掉，这些咬下来的蜡屑堆积箱底便给巢虫提供有利的生存空间，因此在中蜂养殖管理中养蜂人应经常清理蜂箱底部的蜡渣、赘肉、老巢脾并且及时化蜡，不给巢虫留任何生存和繁殖的空间。
三、适时换王
蜂王的优劣是饲养强群的基础，虽然蜂王在蜂群中的寿命可以达到4~5年，但随着年龄的增长，繁殖力逐渐下降，这不利于发展强群，因此最好每年更换一次蜂王，同时自繁自养容易引起种性退化，对此有条件的蜂场每两年引进一些优质的种王以增强蜂场内的遗传优势，从而提高蜂群抵抗巢虫的能力。
四、灭杀蜡螟
巢虫是蜡螟的幼虫，立即消除蜡螟也能防止巢虫滋生。蜡螟多在晚上从蜂箱缝隙和处钻入蜂箱并在蜡渣上产卵，因此养蜂人应及时修补破旧的蜂箱并注意堵塞蜂箱缝隙。在可以用稻草将巢门遮掩起来或关闭巢门以防止蜡螟夜间爬入箱内。同时要经常用苍蝇拍拍打蜡螟，发现一只就杀死一只。
五、灭杀巢虫
巢虫孵化后，会想办法进入巢脾，此时仔细检查巢脾上的巢虫并杀死。隧道中的巢虫可以用镊子取出巢虫并杀死，或者将巢脾浸泡在凉水中也可以杀死巢虫。对于那些还没蛀出隧道，生活在粉脾上的小巢虫可以将蜂抖落掉，然后把巢脾放在阳光下，一看到光巢虫就会立马爬到脾面上，可以用镊子取出杀死。
六、越冬防治
蜡螟一般是幼虫越冬，而且在越冬期有一段断蛾期。此时幼虫大都生存在巢脾和蜂箱缝隙处，抓住其生活史的薄弱环节消灭幼虫对明年的巢虫预防非常有效，养蜂人可以用酒精喷灯烘烤蜂箱将巢虫卵和幼虫彻底消灭，或者将抽出的巢脾放入-7℃以下的冷库中冷冻5~7小时也能达到杀灭幼虫和卵的目的。
七、药物防治
药物防治巢虫在紧急情况下非常有效，目前市场上销售的巢虫药物主要有巢虫清木片、巢虫净、康宽等，巢虫危害严重时养蜂人可以选择这些药物并根据说明书使用，同时二硫化碳、96%甲酸蒸气对巢虫的卵、幼虫也有很强的杀死力，使用时可以根据剂量将这些药物置框梁上密闭熏蒸24小时以上就可以了。
