一、体长的不同
鲤鱼体稍大，一般体长30-40厘米，左右两侧扁，腹部圆，背部在背鳍前稍隆起，口呈马蹄形，吻须和颌须各一对，后者比前者长一倍，腮边短，有咽牙。鲫鱼一般体长15-20厘米，体侧扁，背隆起，高宽，腹圆，头短，吻钝，没有吻须和颌须，腮耙细，有咽齿，鳞片大，有明显的侧线。
二、鱼鳍的不同
鲤鱼鳞片大而圆，胸鳍、腹鳍各一对，背鳍、臂鳍各一个，尾鳍形，背鳍、臂鳍有硬刺，最后一刺的后缘有铅齿。和鲤鱼一样，鲫鱼也有一对胸鳍和一对腹鳍，一对背鳍和一对臂鳍，鱼尾纹叉形，背鳍和臂鳍也有硬刺，最后一刺的后缘有锯齿。
三、颜色的不同
鲤鱼的背面是灰黑色，侧线下的近青黄色（黑色），腹面是白色，背鳍是黑色的。鲫鱼的背面是青褐色，腹面是银灰色，各鳍是灰白色，但生长水域不同，体色也不同。
