一、容器选择
椴树蜜要用陶瓷瓶、玻璃瓶或者无毒的塑料瓶保存，绝对不可以用铜、铁、铝等金属容器来保存，因为椴树蜜含有大量的有机酸等酸性物质，如果用金属容器来保存这些酸性物质就会和金属发生化学反应，实际上，所有的蜂蜜都不可以用金属容器长期保存。
二、保存环境
椴树蜜对保存环境的要求是阴凉、干燥、清洁和通风。阴凉指椴树蜜不适宜在阳光直射的环境下保存，干燥指椴树蜜保存环境的空气湿度不超过75%，通风指椴树蜜不能在通风不良的环境下保存，清洁指椴树蜜要在干净卫生的环境下保存。
三、严格密封
椴树蜜在保存过程中一定要严格密封好，密封的主要目的是防止空气中的水分和微生物进入到椴树蜜中，实际上，包括椴树蜜在内的所有蜂蜜在保存时最害怕的就是混入水分，如果密封不严格的话，具有天然润泽性的蜂蜜就会吸收空气中的水分而快速变质。
四、正确取用
1、椴树蜜在取用时一定要用干净的勺子，如果勺子不卫生就很可能把微生物带入到椴树蜜中，最终导致椴树蜜因为微生物的大量繁殖而快速发生变质。
2、椴树蜜在取用时一定要用干燥的勺子，如果勺子上有水分就很可能使椴树蜜快速变质，因为水会降低椴树蜜的渗透压而使微生物大量繁殖。
3、椴树蜜在取用后一定要及时把容器密封好，如果长时间不密封就很又可能导致椴树蜜提前变质，另外对于已经打开过的椴树蜜最好要在短期内喝完。
