一、种类不同
蜂蛹是蜜蜂和胡蜂发育到蛹期的虫体，从整体上可以分为蜜蜂蛹和胡蜂蛹两种，还有根据蜂种还有更加详细的区分。例如，胡蜂蛹有金环胡蜂蛹、黄脚胡蜂蛹等，而蚕蛹主要指蚕蛾科昆虫家蚕的蛹，因此蜂蛹和蚕蛹实质上是两个完全不同的物种。
二、来源不同
蜂蛹大致分为蜂蜜蛹和胡蜂蛹两种，其中蜂蜜蛹一般为雄蜂蛹，雄蜂蛹大多由养蜂场自行培育，胡蜂蛹的来源主要有两种，一种是收集到野生胡蜂巢中，另一种是人工养殖胡蜂获得的，而供蚕蛹多为人工养殖，野生资源非常少。
三、外观不同
蜂蛹和蚕蛹在外观上有很大差异，其中蜂蛹在形态上具有成蜂的特征，如头、胸、腹、足有了明显差异，颜色呈乳白色，随着发育逐渐加深，但蚕蛹在外观上看起来像一个纺锤，刚化蛹时是淡黄色，然后逐渐变成黄色、褐色。
四、营养不同
蜂蛹和蛹的区别最明显的是蛋白质、糖类和脂肪含量的差异很大，其中蜂蛹中蛋白质的含量在20%以上，糖类的含量在20%左右，脂肪的含量在5~8%左右，但蚕蛹中蛋白质的含量在50%以上，脂肪的含量也在30%左右 ，而糖类的含量在2%左右。
