一、蜂种
土蜂蜜和普通蜂蜜的酿造蜂种不同，其中土蜂蜜是由中蜂（中华蜜蜂）制成的，普通蜂蜜是由意蜂（意大利蜜蜂）制成的，实际上在意蜂还没有引进之前我国的蜂蜜基本上是土蜂蜜，但是在意蜂引进之后，意大利蜂制成的普通蜂蜜主导了蜂蜜市场。
二、蜜源
土蜂蜜与普通蜂蜜的蜜源构成不同，其中土蜂蜜是由中蜂收集山野百花的花蜜制成的，普通蜂蜜是由意蜂收集大宗蜂蜜源的花蜜制成的，普通蜂蜜可以根据主要蜂蜜源细分，例如意蜂主要收集槐花蜜制成的是槐花蜜（洋槐蜜）。
三、营养
土蜂蜜和普通蜂蜜的营养成分不同，虽然蜂蜜的主要成分是葡萄糖和果糖，含有少量蔗糖、氨基酸、维生素、矿物质和酶类等活性物质，但土蜂蜜的蜜源构成比普通蜂蜜复杂得多，因此土蜂蜜的营养成分比普通蜂蜜丰富得多。
四、产量
土蜂蜜和普通蜂蜜的稀缺程度不同，其中中蜂每年只能取1~2次，年平均产蜜量也为10~15斤，意大利蜂的产蜜量与中蜂完全不能同日而语，气候适当时的大流蜜期一个意大利蜂的生产群可以生产百斤蜂蜜，年总产蜜量达到数百斤。
五、价格
土蜂蜜和普通蜂蜜的销售价格不同，其中土蜂蜜的价格基本上在100元以上，少数优质土蜂蜜也可以卖到200~300元1斤，普通蜂蜜多为30~60元1斤。因为土蜂蜜的营养成分比普通蜂蜜丰富，土蜂蜜的产量也比普通蜂蜜少。
