一、技术风险
蜜蜂养殖对相关技术的要求非常高的，实际上很多人养蜂失败是由于技术失败引起的，例如蜂群意外失去王后如果不及时介入新蜂王，整个蜂群就会灭亡，或者发生自然分蜂时，如果不及时处理极易出现损失蜂群的情况，或者在蜂群管理中若不注意卫生和消毒工作则极易导致蜂群患病甚至可能波及全场。
二、气候不适
蜜蜂养殖几乎可以说是靠天吃饭的行业，但天气的变化完全不受人为控制，如果大流蜜期遇到持续下雨蜜蜂就不能从巢里出来收集花蜜，一年的主要大流蜜期都是这个天气的话，那就几乎是白忙碌了一年。另外，蜜源植物的泌蜜是多还是少都会受到气候的影响，所以对养蜂的人来说，大流蜜期遇到连续晴天就是烧高香了。
三、蜂群患病
蜜蜂养殖也无法避免病虫害上的风险，一旦蜂群患病轻则群势和生产力都会受到影响，严重时可能导致蜂群灭亡或弃巢逃跑，更麻烦的是蜜蜂基本很多都是传染病，也就是说一群蜂患病不及时处理极有可能导致全场蜂都患病，事实上很多有规模的养蜂场都是因为病害严重而且得不到有效处理而被拖垮的。
四、农药中毒
蜜源植物分泌的花蜜是蜜蜂酿造的原料，但实际上很多蜜源植物都是农民栽培的农作物，农民在病虫害多发期为了保护农作物经常就会喷洒农药，所以蜜蜂在采集喷洒农药的蜜源而中毒的情况也经常发生，农药中毒轻时会使蜂群的元气大伤，影响养蜂的效益，而农药中毒严重时甚至会导致整个蜂群在1~2天内全群死亡。
五、蜂蜜滞销
蜜蜂养殖的主要产品是蜜蜂酿造的蜂蜜，养蜂人只有销售这些蜂蜜才能获得效益，许多养蜂人可能发展成比较固定的销售渠道，但许多蜂蜜收购人员在收购蜂蜜时也经常大幅度压低价格，此时养蜂人面临的问题要么是低价销售给蜂蜜收购人员，要么这些积存的蜂蜜便因无法及时销售出去而滞销。
