一、与有机肥另行施用
2种肥料混合应用，能够提高肥料的实际效果。
二、施肥后立即覆盖
能够防止阳光直射、杀死微生物、减少生物肥料的利用率。
三、全方位掌握生物肥的基本信息
包括出厂日期、保存期、需求量、操作方法等。如果不现做现用，就要按照标准进行保管，注意遮光、自然通风和干燥。
四、掌握微生物和农作物的关键功效
如根瘤菌肥适用于豆科作物，作为结瘤、固氮的疫苗剂，磷菌肥可以将土壤中难以溶解的磷转换为合理的磷和无机磷等。
五、掌握施工时间和施工技术
可以用“早、近、匀”三个字来进行归纳，即施用时间应尽量早，通常用作为底肥、施肥料和苗肥进行施加。施肥时，农作物根茎的间距要近，种子和苗肥需要翻拌。
六、不与有机肥料、农药杀菌剂化肥互用
会抑制生物肥料中微生物的生长发育，导致杀死微生物，进而危害肥力。 除此之外，还要融合当地的自然环境来有效施肥，注意各营养物质之间的化学变化和抑制作用。
