辣椒根腐病的主要受害部位是根和根茎（茎在表面以下）。病变部位先用水浸泡，然后由浅棕色变为深棕色。与镰刀菌枯萎病不同，病株腐烂部位的维管束变褐，但没有向上部发展。后期病变部位多呈沟槽状，只留下成簇的维管束或皮层，易剥离露出褐色木质部。最后，大多数病株枯萎死亡。根腐病主要由镰刀菌侵染引起。
发病规律
病原菌以菌丝体和厚垣孢子在病渣、土壤和粪便中越冬。病原菌具有高度腐生性，能在土壤中存活10年以上。一般来说，种子不携带病原体。在田间，病原菌主要依靠病土的移动、肥料的施用、雨水和灌溉水、农具等。病菌侵入根和茎基部，损伤皮层细胞，然后进入维管束。发病后，发病部位产生分生孢子，再经雨水和流水传播再感染。
根腐病可能发生在10-35℃之间, 最佳温度为24℃左右, 湿度在80%以上。潮湿多雨，施肥不足，连作地块，地下害虫较多，且可增加病害发生率。
预防措施
一是培育无病苗。播种前，苗床应充分晒晒，并施用足够的腐熟肥料。应多施用生物有机肥。每亩可施用腐熟鸡粪或牛粪4000公斤，生物有机肥320-450公斤，硫酸钾复合肥40公斤。
二是实行轮作。重病地块应与十字花科、洋葱、大蒜类蔬菜轮作3年以上，最好与玉米、小麦等粮食作物轮作。每亩连作地种植前用20公斤微生物菌剂处理。
三是采用高垄栽培。浇后防止雨水和积水，增强根系的渗透性。
四是对症下药。发病初期，苗期每亩施用土壤改良剂200克或复合微生物肥1500克，稀释液200克/株；在发病初期，可以用容克灌根或每亩4公斤硫酸铜。
通过我们近几年的田间试验，我们还可以用77%couzade可湿性粉剂或50%甲基妥布霉素可湿性粉剂500倍液防治，也会取得很好的疗效。但应提前预防，并在基底和地面上喷洒或灌溉。
