一、产地存在差异性
1、肉苁蓉
肉苁蓉是需要在梭梭树上面寄生的一种植物，只有沙漠中的环境才有利于肉苁蓉的生长，也正因为缓解的恶劣，让肉苁蓉的价值非常高。目前我国新疆、内蒙阿拉善盟、甘肃、宁夏等地均有生产，一般野生肉苁蓉比人工培育的肉苁蓉质量更高。
2、草苁蓉
草苁蓉的生长环境不如肉苁蓉要求高，也没有那么恶劣，但必须满足其特殊需求才能生长。海拔1200米至海拔1300米的悬崖陡壁是草苁蓉最喜欢的生长环境，同样具有顽强的生命力，在我国黑龙江、吉林、蒙古有生产，可作为肉苁蓉的替代品。
二、价格差异性较大
1、肉苁蓉
肉苁蓉生长在环境恶劣的沙漠中，在其他地方生长困难，所以肉苁蓉产量相对较少，采摘困难，且因为肉苁蓉中营养物质非常丰富，所以肉苁蓉市场价格相对较高，便宜时需要两三百一斤，质量更好的肉苁蓉可能需要上千元一斤。
2、草苁蓉
草苁蓉生长地区比较多，也相对比较常见，所以草苁蓉价格比肉苁蓉便宜得多，大致价格从几十元到几百元的样子，具体草苁蓉销售价格与草苁蓉品质有关。
三、成分具有明显差异
1、肉苁蓉
肉苁蓉之所以显得宝贵，主要是含有的成分对人体很重要。其中含有生物碱、氨基酸、木脂素类等，其中苯乙醇总苷是肉苁蓉中重要的一个活性成分，对男性性能力的改善有明显的效果，对女性的衰老和宫寒也有帮助。
2、草苁蓉
草苁蓉与肉苁蓉成分有相似也有不同似，其中草苁蓉含有草苁蓉醛、草苁蓉内酯、甘露醇和生物碱等成分，其中CR超级激酶是一个很重的物质，可修复基因和细胞。
