一、种类不同
翠云草和卷柏都是卷柏科卷柏属多年生草本植物，但却是不同的品种。翠云草为中型伏地蔓生蕨，卷柏为土生或石生复苏植物。
二、根茎不同
1、翠云草为中型伏地蔓生蕨，主茎伏地蔓生，根托只生于主茎的下部或沿主茎断续着生，根少分叉，被毛，茎圆柱状，具沟槽，无毛，侧枝5-8对，2回羽状分枝。
2、卷柏为土生或石生复苏植物，呈垫状，根托只生于茎的基部，根多分叉，密被毛，与茎及分枝密集形成树状主干，茎卵圆柱状，不具沟槽，光滑，侧枝2-5对，2-3回羽状分枝。
三、叶子不同
1、翠云草的叶子边缘全缘，主茎上的叶比分枝上的大，绿色，分枝上的腋叶宽椭圆形或心形。
2、卷柏的叶子边缘不为全缘，主茎上的叶较小枝上的略大，绿色或棕色，分枝上的腋叶卵形或椭圆形。
四、分布不同
1、翠云草分布在浙江、福建、台湾、广东、广西、湖南、贵州、云南、四川等省区，生于海拔40-1000m的谷林下，多腐殖质土壤或溪边阴湿杂草中，以及岩洞内，湿石上或石缝中。
2、卷柏分布在广东、广西、福建、浙江、江苏、湖南、陕西、河北、山东、辽宁、吉林、黑龙江等地，多出生在阳光明媚的山坡岩上或干旱的岩缝中，常见于石灰岩上，海拔（60-）500-1500（-2100）米。
