一、产卵
燕鱼是卵生鱼类，繁殖比较简单。仔细观察配对成功的双鱼，如果肛门附近开始突起，即输精管、产卵管开始下垂，这是产卵前的征兆，它们会在产卵前选择认为安全的区域。雌、雄鱼会将产卵区啄食干净，然后雌鱼开始产卵，而雄鱼在雌鱼产卵的同时进行受精。一般来说，整个产卵过程持续数小时，产卵数量视为成鱼的大小，一般为400~1000不等。
二、守卵
产卵结束后，雌雄鱼会一起保护鱼卵，轮流用胸鳍扇动水流，确保受精卵有足够的水溶氧，当有些鱼卵因为没有受精或者被水霉感染而变白、发霉时，它们会立即啄食，确保其他受精卵不受感染，整个维护过程十分感人。
三、照顾小鱼
这样不吃不喝管理的36小时后，小鱼开始孵化，但依然不会游泳，依附于原地吸收自己的蛋黄素，度过漫长的4~5天再开始游离产卵点，摄食体型微小的水蚤。在此期间，雌雄和雄鱼仍然保护着它们。因此，为了创造一个良好安全的产卵环境，最好是在燕鱼出现产卵前的征兆的时候，就放入另一个为繁殖用的水族箱中单独饲养，同时用气泵辅助提供充足的水溶氧，期间不宜过强的照明灯光，也不宜使它们过度受惊，过度受惊将会导致它们吞食所有已经产出的鱼卵。更不用投喂饵料，以免污染水质，尤其是活饵。混合在水蚤中的一种剑水蚤可以穿透受精卵的外壁，使鱼卵孵化率大大降低。
