在禁捕退捕工作中，云南省各地还积极创新监管机制，创新成立昭通市水富市“两江”（金沙江、横江）综合执法大队，实现多头执法向综合执法、专业化执法转变；迪庆州成立了“迪庆州香格里拉金沙江土著鱼类恢复保护协会”，坚持长期对金沙江段进行宣传和巡护，协会巡护范围从迪庆州全境扩展到丽江市华坪县。
针对退捕工作，云南省也针对退捕工作，将坚持深入开展退捕渔民渔船信息建档立卡“回头看”，并完成了退捕渔船建档立卡199艘、完成率100%；退捕渔民建档立卡377人，完成率100%；销毁网具123件套，占全部需要销毁网具的61.8%。
目前，云南已经向退捕渔民兑付补偿金超过1200万元。通过以上的管理方式和模式也得到了更好的禁渔效果，助力渔业更健康发展。
