近日,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室团队近日合作绘制了水稻活跃基因以及异染色质参与的高分辨率三维基因组图谱,揭示了水稻三维基因组结构对基因的转录调控,以及遗传变异对三维基因组结构及基因表达的影响。
此次基因图谱绘制是继今年6月份,华中农业大学科研团队成功绘制玉米活跃表达基因参与的高分辨率三维基因组图谱后的又一次创举。
据介绍,针对水稻方面,研究人员提出水稻基因组在空间上可划分为几类具有不同转录活性的染色质交互模块,共覆盖了大约82%的水稻线性基因组区域。此外,通过水稻不同品系间基因组变异数据的分析,研究人员揭示了功能性遗传变异对水稻染色质拓扑结构及基因转录调控的影响。
同样针对别的农作物,通过绘制基因图谱,我们就能更清楚的了解农作物的结构,通过生物技术的参与,可以将“残次品”的基因进行改写,大大提高农作物的质量,从根本上增产增值,做到不浪费一粒粮食,让农作物可以最大程度上的高产能。
三维基因组是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因范围内整个染色体DNA在空间位置上的高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。所以,三维基因组手段是破解遗传机理的“关键钥匙”,通过三维基因组的手段来解析农作物中顺式调控元件的作用机制显得尤为重要。而传统三维结构研究方法受限于精度不高等因素,很难得到高分辨率的三维结构图谱,制约了科学家对这一机制的破解。
农作物高分辨率三维基因组学研究和基因间的互作调控研究发现,有助于我们深入理解农作物空间结构与各种表观修饰及基因表达的关系,对农作物遗传改良和其他经济作物的研究具有重要的指导意义和科学价值。