畸形原因
花芽分化不良花芽分化期遇到了不适宜的温度、供水不足、连续阴雨光照不足等环境因素，导致花芽分化障碍，在花芽形成以后就处于畸形状态，结出的果实也就是畸形的。或者是在授粉受精过程中遭遇以上不良因素，使得授粉受精不良，最后形成不正常的花或果实。如黄瓜曲形瓜。
根系受伤或者发育不良瓜类作物植株根系发育不良时，养分吸收受到抑制，植株抗性下降，叶片生长不良，光合产物以及所吸收的营养不能很好的输送到瓜条中去，容易造成瓜条畸形并且空心。
肥料使用不合理
缺乏钙硼肥料只要是结果类蔬菜，在结果盛期都需要大量的钙肥，所以如果瓜类蔬菜钙硼肥缺乏，也会造成瓜条空心，口感发苦，黄瓜上会出现细腰瓜。
氮肥施用过多番茄中出现的多心室巨形畸形果，一般是由于栽培过程中，氮肥施用过多，导致花芽过度分化，心室数目增多造成的。
温度、光照条件不适宜尤其是夏季，温度较高，若遇连阴天，一些在遮阳网下进入开花坐果期的作物，会由于长时间的缺乏光照，出现花果焦化、果实畸形的情况。冬季温度较低，若作物连续受低温障碍，也会出现畸形果。
植物生长调节剂使用不当为达到保花保果的效果，番茄生产过程中过多使用2,4~D或防落素等植物生长调节剂，但是使用过程中药剂使用浓度过大、蘸花时间选取不当、温度不合适、重复蘸花等因素，均容易形成畸形果。
病虫害原因导致畸形花果的主要就是病毒病。番茄、西葫芦、黄瓜、苦瓜等蔬菜受病毒病影响较为严重，常造成大量畸形花果的出现。
预防措施
做好苗期管理，确保花芽分化正常
保证适宜的育苗条件在育苗期间，控制适宜的育苗条件是防止畸形果的关键。一是培育适龄壮苗。二是幼苗出土后要控制好温度和肥料使用，生产中避免作物在超出耐受低温以下进行低温炼苗和多氮肥育苗。
幼苗管理根据不同作物对温度的要求，控制田间温度，防止长时间遭遇低温或高温影响。
控制氮肥的使用，防止营养生长过旺，同时要注意补充硼、钙等中微量元素，施用有机水溶肥料，养护根系，培育健壮植株。
适当浇水，避免土壤中水分发生剧烈变化。根是吸收矿质营养的主要器官，根系吸收能力的强弱也决定了养分供应能力的高低。
在开花坐果之前，强壮的根系可满足植株营养生长和生殖生长所需要的矿质元素，一旦根系的吸收能力渐弱，营养供应出现问题，那么势必会影响到地上部分的生长，也会对立即转入生殖生长的植株造成严重的影响。
及时做好疏花疏果例如番茄，正常花蕾萼片数为5~7枚，萼片在9枚以上者为畸形花，应及时摘除。
每穗结合蘸花疏掉每一穗中第一朵最早开放的花，易形成畸形果，待每穗果坐齐后，再及时疏掉因蘸花而形成的残花和畸形果。
合理使用植物生长调节剂(以番茄为例)
正确合理使用生长调节剂蘸花，能够有效降低番茄畸形果的发生。
选用适合的浓度要根据植株的长势，蘸花时的温度，合理配比。一般情况下，温度高时浓度低，温度低时浓度适当高;植株长势旺时，浓度适当高，植株长势弱时，浓度适当低。
要选择合适的时期和时段一般选择是一穗花第二朵和第三朵花花瓣完全开放，并且伸长到喇叭口时，点花为宜，点花过早易形成僵果，点花过晚会造成畸形果或裂果。最好选择在晴天上午，叶片上没有水滴时开始点花。
注意点花不能重复，重复后会造成药液浓度过高，容易产生畸形果，可在配置的药液中加入少量的红色颜料或墨汁做为标记。
