近年来，云溪区加大环境保护力度，实行最严格的环境保护制度，加强环境治理和生态修复，筑牢生态安全屏障;严把环保第一审批权关口，全区范围内禁止新上矿山石场，园区外禁止新上化工企业，生态涵养区禁止新上畜禽养殖场，坚决控制新增污染;严控农业面源污染，禁止使用剧毒农药，减少农药和化肥使用量，有序开展畜禽退养工作;推进城镇、园区污水管网建设和农村改水改厕，提升垃圾和污水处理率。同时，启动实施第三轮“环境整治三年行动”计划，着力治理化工历史污染和养殖污染，逐步取缔布局分散、污染严重的“小化工”和畜禽、水产品养殖场，继续开展松杨湖、云溪河历史污染治理工程，大力推进大气、水、土壤污染防治。
目前，该区正在稳步推进白泥湖国家湿地公园和清溪省级森林公园专项规划和基础设施建设，清溪生态休闲旅游度假区正在进行前期规划设计，有望在2020年建成国家AAA级景区。
