需要注意的是，近年来关于绿色农业存在不少认识误区，有些甚至流传甚广、影响颇大。例如，只要提到化肥、农药、饲料和添加剂，不少人就会心生反感;只要提到农产品质量安全，不少人就会想到发展有机农业、纯天然农业。在一些舆论宣传、广告推介中，往往把质量安全等同于不用化肥、农药，不喂饲料、添加剂。在这种社会氛围下，提出让农业绿起来、实现农业绿色化发展的新目标，一定要防止走极端，防止一味抵制和排斥现代科学技术成果在农业中的应用。让农业绿起来，绝不是要退回到工业文明之前的传统农业。那时的农业当然是绿色、有机的，但靠那种农业怎么可能养活得了今天这么多人口?不用化肥和农药的种植业，不喂饲料和添加剂的养殖业可以少量存在，但难以成为现代农业的主流。对我国几千年农业发展史的研究表明，在使用人力和畜力、耕地不休耕和轮作、靠人畜粪肥维持地力的条件下，要实现氮这一主要营养元素的平衡，粮食亩产只能达到100公斤。这与现代农业能够达到的亩产400公斤相去甚远。
现在我们所追求的绿色农业，本质上是以科学技术为支撑、以现代投入品为基础的集约农业。化肥、农药并非洪水猛兽，关键在于科学施肥、合理用药;饲料、添加剂并非产不出高品质畜产品，关键在于科学饲喂、遵守规范。在下一步的农业发展中，应扩大测土配方施肥在设施农业及蔬菜、果树、茶叶等园艺作物上的应用，尽快实现主要农作物测土配方施肥全覆盖。建立反应快速、服务高效的病虫害专业化防治服务组织，大力推进专业化统防统治与绿色防控融合，有效提升病虫害防治组织化程度。加快制修订农兽药残留标准，尽快制订推广一批简明易懂的生产技术操作规程，推进园艺作物标准园、畜禽标准化养殖场和水产健康养殖场建设，大力扶持新型农业经营主体开展标准化生产。
用绿色理念发展农业，要求在投入品使用、产地环境保护、生产经营方式、市场营销体系等方面进行一系列深刻调整。与增产导向的农业相比，绿色农业的生产成本肯定要高出一大截。要让生产者有发展绿色农业的积极性，就必须让他们得到足够高的回报。如何为绿色农业定价、让消费者为农业绿色化付费?一些地方的经验表明，培育农产品品牌、为产品贴上绿色标签是可行路径。有了品牌，消费者可以降低信息搜寻成本，增强消费信心和购买意愿。单家独户的小规模农业无法形成品牌，必须提高农业生产的组织化程度，发展农民合作社。一家好的合作社，不仅要遵循合作制的基本原则、发挥农民的主体作用，而且要有一个叫得响的产品品牌。建立互联网平台，有利于农民合作社培育品牌、直销产品。
让农业绿起来，需要全社会共同行动。政府应积极作为，加快制订完善农业投入品生产、经营、使用的标准和技术规范体系，加快推进全国农产品质量追溯管理信息平台建设，推行农产品质量标识制度。媒体应科学理性对待局部地区、个别产品生产中存在的问题，不能为了吸引眼球而夸大问题的严重性，切实对生产者和消费者负责。
