从发病的症状来看，本病从种子未出土至幼苗3对真叶期均可发病，一般以1-2对真叶期发病最重。主要类型有：土内腐死型、立枯型、猝倒型和主根腐烂型。一般症状为幼根和叶子下胚轴产生水浸状病斑，逐渐变成褐色至黑色，患部变细呈绞缢状。发病轻时，植株仍保持正常绿色。因病变只达幼苗表皮或初生皮层，尚未达到髓部，幼根脱皮，幼苗可恢复正常，但易形成葫芦形根。幼苗立根烂掉的，则形成叉根或畸形根。
从发病条件来看，因病原菌种类不同而不同。水生真菌苗腐病原菌与土壤湿度关系极为密切，湿度越大，发病越重。温度低、发病重，排水不良的低洼地，土质黏重或土壤结构不良，播种遇雨土壤板结，播种前整地粗放，种子质量低，种子发芽势弱，土壤瘠薄或酸碱度过高或过低，都会引起甜菜立枯病加重。
从防治方来看，(1)农业防治。精细整地，要求疏松土壤，上虚下实，清除杂草根茬，无坷垃，结合施肥，达到深、松、平、净、肥的标准，前茬作物收获后，采用秋深翻25-30厘米，冬季镇压，早春耙耱，防止失墒。雨水到惊蛰之间镇压。(2)种子处理。选用抗逆性的甜菜如甜研303、304、305多倍体优良品种。(3)药剂防治。播前摊晒2-3天后碾碎种球，可提高发芽率和节省种子。为防治立枯病，可用福美双0.25公斤对水拌50公斤种子，也可用保苗灵，每50公斤种子拌1小袋保苗灵。(4)合理轮作。实行5-8年以上轮作，切忌重茬迎茬。(5)增加磷肥。每亩增施磷肥50公斤，促进幼苗生长，提高抗病能力。
