随着现代农业的不断发展，农机使用领域越来越广，范围越来越大，农机给农民的生产提供了便利，与此同时，农业机械化发展存在着问题。
1、地区之间农业机械化水平严重不平衡
目前，我国农业机械化过程体现了与中国农村社会经济、文化背景相适应的有别于经济发达国家农业机械化的特点，这就是农业机械化水平的不平衡性。由于我国地理条件与气候条件的差异，存在着土地相对稀缺与农村劳动力过剩，且农村人均投入水平较低、存在着地域间的差别等因素决定了中国农业机械化的过程在全国不同区域、不同生产条件、不同经济发展水平等条件下，将体现出不同区域的发展特点。我国一些经济较发达区域，农业生产水平较高，农民收入增长较快，农民对农业机械的购买数量较多，农业机械化发展速度相对较快;而相对于我国经济欠发达的地区来说，农业机械化的发展速度慢，农机拥有量少，农业生产水平低，农民收入增长缓慢。
中国西南地区农业机械化水平在全国最低，原因在于其不利的地理条件、落后的经济状况及大量的农村人口。提出了在新的环境条件下改善这一状况应采取的措施：利用中国加入的机遇，因地制宜，采用正确的发展战略，合理地选择农业机械、机械化技术及机械化环节，借鉴外国与国内其它地区的经验，集成有关的技术、措施和政策，在机械化技术、农业机械的管理和推广、服务体系建设以及相关的措施、政策等方面实施创新，通过农业产业化、信息技术、适用技术发展农业机械化，加强研究开发工作，加强农村基础设施建设。此外，还需要一套全国性的法规政策体系来促进农业机械化工作。
2、农业机械装备总量不足结构不合理
一是部分农业机械老化严重，更新换代乏力;二是运输机械多，农田作业机械少;三是动力机械中小型机械多，大中型机械少;四是农机作业配套机具少，配套比率低;五是低档次机具多，适应农业结构调整的新型机具少，高性能机具少。
3、农机门类品种上存在明显缺陷
我国农业机械化水平在不同作物、不同生产环节上存在着较大的差距。目前，最突出的问题是水田机械化水平太低。近几年，我国水稻种植面积和产量下降，南方一些地区出现的土地抛荒现象与水稻机械化严重滞后具有直接联系。在农田作业各主要环节上，收获机械化是水平较低需求最大的一类。此外，玉米收获机械化在少数地区处于刚刚起步阶段，棉花机械收获仍属空白，具有节水、节肥、节种等性能的机具也不同程度地存在数量不足、水平不高的问题，影响了节本增效技术的大面积推广应用。由于农机门类品种和适用性上的缺陷，使农机产品存在过剩与短缺并存的现象，制约了农业机械化的全面发展和农机效率与效益的提高。
4、农机使用中存在的问题
农业机械的作用在于农民的购买、使用和取得效益。但是，有许多地区存在农民买不起、用不好和效益差的问题，影响和制约了农机数量和水平的提高。其表现为：一是“买不起”。一般农田作业机械，大中型的需要5万-10万元，小型的需要0.3万-1万元，一次性投资大。而目前我国农民收入水平较低，支出负担重，资金筹措困难，农民对农业机械的购买力不足。虽然许多地方都出台了购买农机补贴政策，但效果不是非常明显。二是“用不好”。农机管理部门经费不足，农机具的引进、试验、推广工作以及农机技术无偿培训工作难以开展，农民素质得不到有效地提高，造成部分农民虽然买得起农机，但也用不好农机。三是“效益差”。由于农民文化素质比较低，培训机会少，不能科学地使用农机，造成故障多、效率低。同时，农机作业市场尚未完全形成，农机具闲置与非田间作业时间多，经济效益不高，直接影响了农民购买和使用农机的积极性。
5、农机服务组织化程度低整体效益差
乡镇农机管理服务工作下滑，农机维修管理关系不顺，农机社会化、专业化、市场化运行机制还没有真正形成，有实力的农机大户少，农机专业服务队、农机协会等农机合作服务组织的发展刚刚起步，还不够规范。分散在千家万户的农业机械使用水平低，农机经营总体效益差。
6、农业机械装备结构不合理
大中型机具较少，小型农机具居多，配套率过低，农机作业范围狭窄，致使其整体功能的发挥受到限制，从而影响了农业由粗放型生产向集约化生产的转化。农机化发展中存在结构性矛盾，农机总量增长较快，但先进技术的应用仍较慢;虽然农业产业结构调整力度加大，农机已开始向一些特色产业应用，但应用的步伐仍较慢。
7、农机具科研开发配套系统建设落后
新技术、新机具发展缓慢，满足不了当代农业生产的需要，农机化科研、推广队伍亟待壮大。示范手段落后，信息化、标准化建设滞后，不能及时掌握有关农业产业结构调整的动态信息，难以满足实际工作的需要。
