为确保畜产品质量安全，曲阜市畜牧兽医局不断创新监管方法，强化对兽药、饲料等畜牧业投入品生产销售使用环节的日常监管。主要采取了以下监管措施：
加大对兽药饲料等畜牧业投入品生产销售使用企业的法律法规宣传力度。着力提高他们的责任意识、守法意识和诚信意识，以规范他们的生产经营使用行为，力争实现违禁投入品的“三不”：即不生产、不经营和不使用。进一步明确了企业的责任主体地位，建立企业首负责任制。
严把投入品生产经营许可关。本着“从严从紧”的原则，严格投入品生产经营许可条件，严格按照审批步骤办理许可。不断提高入行门槛，提高整个行业技术水平。
加强投入品生产经营企业的证后监管。对辖区2个兽药生产企业、15个兽药经营企业、7个饲料生产企业、12个饲料经营企业采取定期检查与不定期抽查相结合的方法，不断督促和强化企业严格按照GMP、GSP质量管理规范生产经营。加大对重点领域、重点产品和重点环节的监管力度，实施规范生产经营兽药、饲料等投入品的强制措施，不断规范其生产经营行为。不断建立健全畜产品质量安全追溯体系，切实落实畜产品质量安全追溯制度。
加强对规模养殖环节的有效监管。积极引导发展规模化、集约化、标准化养殖。督促养殖场建立健全档案，详细登记投入品的来源、名称、使用时间和用量等。依法取缔饲喂违禁投入品的饲养户，规范其饲养方式，从而实现对养殖环节的有效监管。严格产地检疫制度，对出栏畜禽按照一定比例实施抽检，坚决杜绝问题产品流入市场。
加大投入品的监测面积与频率，严厉打击制售、使用违禁投入品的违法行为。不断加大对违禁投入品和动物及动物产品的抽查检测力度，加大对违法行为的惩处力度。始终保持严打的高压态势，一旦发现违法行为，严厉处罚，绝不姑息。
构建畜产品质量安全社会共治格局。对畜牧业投入品的违法行为，建立有奖举报的激励机制，畅通举报渠道，鼓励群众参与监督检举，对违法生产经营使用投入品的行为进行彻底整治，使违法行为无处藏身。
