在庞大的玉米育种工作中，从组织群体开始，随机自交，低代分离，逐代选株、选系；到外引系拓广、扩群；再到优良品系的去杂保持，玉米自交工作非常繁杂。为适应当前资源广阔、品系繁多、血缘复杂、人工不足、时间紧俏的现状，在玉米自交过程中注意给幼穗套小袋、观察等待吐丝散粉、取粉授粉等操作，以促进玉米的育种。
1 给幼穗套小袋
科研人员工作繁忙，大量的套小袋工作，可以交给临时工负责，通过指导他们就能胜任。科研人员在授粉过程中，也要检查、修正临时工的不足，以确保套袋工作质量。这是因为在套袋过程中往往会出现以下几种情况：一是观察角度不同，有可能看不到幼穗。如在顺垄观察时，长度4、5 cm的幼穗，其粗细程度要小于茎秆粗细，如果恰好站在幼穗相对于茎秆的另一侧，会被幼穗挡到，所以一定要前后左右多加观察。二是有些品系株型上冲，茎叶夹角很小，需要轻轻按下叶片，才能看到。下压角度不宜太大，以防叶片折断，影响后期灌浆。对于长度低于4 cm的雌穗来说，最好查一下往年记录，着重注意吐丝时期和吐丝速度。如果该系在幼穗很小的时候就吐丝，那么此刻就必须套上小袋；反之，可以再等2 d.因为如果在幼穗很小的时候套袋，纸袋容易掉落，套的太紧还会影响幼穗发育[1].如果决定过几天再套，还需要注意一下未来几天的天气情况。三是科研人员应尽力补足临时工的工作。临时工24 h前套的小袋，因为过1 d后，幼穗长大了一点，纸袋也会升上去一点，这时要求把袋子往下套紧，防止小袋掉落。临时工48 h前套的小袋，纸袋以下幼穗露出的部分又多出一些，若再不套紧，风轻轻一吹，小袋就会掉落。四是纸袋套的程度要掌握好，最好是深入到叶鞘里面，夹在幼穗、叶鞘和主茎之间。此外，需要注意的是，如果过了好些天，或者吐丝晚，或者散粉晚，以致于还未能授粉，此时幼穗长大，会顶到纸袋的顶部，需要把纸袋从叶鞘中提出来，以防雌穗顶破纸袋，如果顶破纸袋时恰好雌穗吐丝，会造成授粉失败[2].若授粉失败，就要着重观察一下植株上是否还有幼穗。对于自交系来说，一株多穗现象很常见，要把吐丝的幼穗除去，以防此穗和试验用穗抢夺营养。除去玉米穗的方法如下：捏着幼穗上部，顺着主茎的方向，以横向偏下的力量拉扯，稍有点爆发力，顷刻把幼穗完整地扯下来。以这样的方法除去幼穗，不会伤到叶片，因为这片叶子往往也是试验用穗的棒三叶，与后期灌浆息息相关。
2 自交授粉
授粉过程经过几代玉米工作者的逐步摸索，尤其在工作量大、时间紧的环境下，比以前已经大大简化。抛开了大袋，采用小袋当天直接取粉的方法进行自交授粉。如果发现雌穗已经吐丝，先观察此株是否已经散粉，有些自交系最上叶片会包裹住雄穗，最好手动把叶片捻开[3-4].然后用小袋套住雄穗，掸下花粉。把花粉聚集的那一角折起来，防止花粉散落，再套在雌穗上，要让雌穗顶部紧贴折叠的那一角。然后打开折角，掸落花粉，再晃动几下纸袋，写好标签，套在雌穗底部。在自交授粉过程中要注意：一是标签不只要写明该系名称或者代号，如果本株另有独特的特点，也要标明，用以标识本株的特征。在后期收获的时候，此标签也要跟随此穗。二是标签套在试验穗上，不要随意套在任一节上。因为如果遇到1株多穗的品系，后期收获时会分不清自交穗和自然穗。
3 自交工作中的附属其他工作与注意事项
一是自交系要进行选株。对于病株、畸形株，过于矮小、高大、细弱、粗壮的单株不可选。尤其是病株，最好折断后扔到田间渠道上。二是如果发现某一小区植株过密，就要手动间株，否则会形成空秆，或者棒穗无籽。间掉的植株最好是病株、细弱的单株。三是如果发现外观特殊，且株型合理，要重点留意，特别对待。四是某些低代系，雌穗苞叶很长，这会影响套小袋，最好的做法是用剪刀把苞叶的叶片部分剪下，再套上小袋。切忌连叶柄剪下，否则会影响吐丝。五是某些品系会有雌雄不调的现象。若散粉晚，可等上几天；若吐丝晚，最佳方法是顺其自然，授不上就淘汰。但是如果此品系很重要，那么重点挑2株，把雌穗上部剪掉2 cm左右，或者更多，直到露出花丝，再进行授粉；再挑2株，做姊妹交；剩下的做全区混粉，以待来年后代中能出现雌雄调和的单株。六是对于纯自交保留的品系，授粉一穗成功后，尽量把此株其他的幼穗全去掉，防止抢夺营养。七是对于重点的还要做侧配或者杂交试验的品系，如果其株型合理，供应的起双棒，就2穗全套上小袋，1穗自交保留，1穗做侧配或者杂交试验，这是真正的“一对一试验”.八是对于自交系中选择作父本的品系，在自交取花粉的时候，尽量不要伤到雄穗，因为其花粉还要进行杂交试验。九是如果在幼穗茎节处发现害虫，要手动杀虫。如果此品系虫害很重，查看其品系来源，如果不是重点，则整区淘汰。
