在达到性成熟的黄鳝群体中，较小的个体是雌性，较大的个体主要是雄性，两者间的个体被称为雌雄间体，而这种呈雌雄间体的性腺组织实际上是一个动态过程，在这个生理变化过程中，有功能的雌性转变为有功能的雄性。黄鳝的幼体性腺逐步从原始生殖母细胞到分化成卵母细胞，黄鳝从幼体进入成体，性腺发育成典型的具有卵母细胞和卵细胞的卵巢，以后又逐渐发展到变成成熟卵，这就决定第一次进入性腺发育成熟的个体都是雌鳝。雌鳝产卵后，可以明显地发现性腺中的卵巢部分开始退化，起源于细胞索中的精巢组织开始发生，并逐步分枝和增大，即性腺向着雄性化方向发展，这一阶段的黄鳝即处于雌雄间体状态。这以后卵巢完全退化消失，而精巢组织充分发育，并产生发育良好的精原细胞，直到形成成熟的精子，这时的黄鳝个体已转化为典型的雄性。这时,生殖腺排出的不是卵子,而是精虫,此鳝变为雄鳝后就不再变了,终生以雄性存在。
黄鳝性腺是一根管状器官，位于腹腔右侧。开始均为雌性，其发生发展、性逆转过程如下：
雌性时期：卵巢外有一层结缔组织形成的被膜，膜内为卵巢腔，充满形状各异、大小悬殊、不同发育阶段的卵母细胞，卵径0.08～3.7毫米。
I期：卵巢白色，透明细长。肉眼看不见卵粒。解剖镜下可见透明细小的卵母细胞，核大，胞质少，卵径0.08～0.12毫米。体长5.9厘米、体重0.4克的仔鳝，解剖后可找到细小而透明的卵巢；体长8.2厘米的幼鳝卵巢内充满细小而透明的卵母细胞。
II期：此期的卵巢比I期稍粗，卵巢呈白色、透明。肉眼看不见卵粒，解剖镜下可见卵巢内充满透明细小的卵母细胞，卵径为0.13～0.17毫米，全长15厘米以下幼鳝的卵巢多为II期。
III期：卵巢已由白色透明转变为淡黄色、肉眼可见卵巢内有很多细小的卵粒解剖镜下可清晰地看到圆形或不规则形的卵母细胞。细胞内已沉积较多的卵黄颗粒。卵径为0.15～2.2毫米。同时，卵巢内存在着少数I、II期的卵母细胞，一般处在III期性腺的幼鳝全长为15～26厘米。
IV期：卵巢明显粗大，卵母细胞亦明显增大，卵粒大小较一致，颜色也由淡黄色变为橘黄色。解剖镜下可见卵颗粒充满整个卵母细胞，核也逐渐边移。卵径2.2～3.4毫米，此期的黄鳝全长10～30厘米，极少数可达40厘米以上。发育到IV期末的卵巢长占鳝体长的44.6～59.2%，平均为53.2%（从生殖孔到头部为止）。
V期：卵巢粗大，内充满了橘黄色的卵粒，呈圆球形。卵径3.3～3.7毫米。卵母细胞内充满了排列致密的卵黄球，细胞核边移到卵的一端，卵在卵巢内已成游离状。
雌雄间体阶段：多数黄鳝在2龄后，全长24.5～37厘米时开始转入这一时期，个别全长可达45厘米以上，此阶段性腺被膜加厚，卵巢逐渐退化，精巢逐渐形成。间体初倾向于雌性，后期倾向于雄性。显微镜下可见少数残留的细小卵粒，这些小卵粒不会再发育成熟，而是逐渐退化吸收，以及分解成橘黄色的絮状物，同时也可看到刚形成不完整的曲精小管。
雄性阶段：多数黄鳝在3龄以上为雄鳝，也有2龄就逆变为雄鳝的。未成熟的精巢细长、灰白色，表面分布有色素斑点。显微镜下可见曲精小管及不活动的精子，性成熟的精巢较原先粗大，表面分布有形状不一的黑色素斑纹，显微镜下可见数量多而小的活动精子。
综合国内外学者对黄鳝性逆转的调查研究，可以概述如下：体长200毫米以下的成体黄鳝均为雌性；体长220毫米左右的成体开始性逆转；体长360～380毫米时，雌雄个体数几乎相等；380毫米以上时，雄性占多数；530毫米以上时，则全部是雄性。但是，逆转也受环境条件等因子的影响，很可能在生物饵料丰富的状况下，黄鳝的生长加速，在同样的生长期却出现了超乎寻常的体长。
环境因子对黄鳝性逆转的影响
在生产实践中经常发现个体很大的雌鳝和个体很能小的雄鳝，可见诱导黄鳝性逆转的原因是多主面的。
水温的影响
黄鳝的变温动物，水温的变化直接影响其生命活动的强弱，也影响性腺发育的历程。黄鳝的生活的适宜水温为15～30℃，水温低于15℃或高于30℃，黄鳝的食欲减退，摄食量减少，生长发育受阻。温度变化越快，温差越大，影响越大。水温超过35℃或低于10℃或短期内温差大于5℃，则导致黄鳝性腺发育停止。
酸碱度的影响
黄鳝适宜在中性或偏酸性的水体中生活，池水pH值大于7，则影响黄鳝性腺发育，pH值越大，影响越大，当池pH值达到10时，黄鳝急躁不安，不摄食，如时间达7～10天，皮肤开始溃烂，不久即死亡。所以新建水泥池要经脱碱处理后才能用。用生石灰进行水质消毒或换水时，要注意池水pH值的变化。
水深的影响
黄鳝的鳃严重退化，在水中不能单靠鳃进行呼吸，必须借助胸鳍、鳍褶、口腔、咽腔、皮肤等副呼吸器官进行呼吸。在自然水体中，黄鳝可以直接呼吸空气中的氧，即使水中溶氧不足，也不会对黄鳝生长发育造成太大影响。但是，在砖石结构的池塘中，如果池水太深，黄鳝立柱就失去支点，就不能呼吸空气中的氧。在长期缺氧条件下，性腺发育历程延长。
声音、光照的影响
黄鳝昼伏认夜出，喜欢生活在清静的水域环境中，所以不宜把黄鳝池建在夜晚吵杂、闪光的路边。实验表明，夜晚给予噪音和闪光刺激性腺，发育速度慢，性成熟推迟，体长平均至40厘米时仍为雌性。
性别比例的影响
在生殖季节，单纯的雌体群体会因为缺少雄鳝，而其中的一部分雌鳝提前逆转为雄性。所以经常会发现个体很小的雄鳝。
饲养管理的影响
黄鳝以动物性饵料为主，食性杂。若饵料质量高，新鲜，投喂均匀、及时，则性发育快。若饵料质量差，投喂不均匀，不及时，则会推迟性成熟。水质差，换水过频或换水时流速大，温差大都会延缓雌鳝性成熟。
准确的性别鉴定是黄鳝人工繁殖的关键。体长、年龄、季节都不足以作为鉴定的标准，只能参考。鉴别时一般可以从形态和生理两个方面综合判断。雌鳝头小不隆起，体背呈青褐色，无斑点，不善跳，性情温和，在繁殖季节里，腹部膨胀，呈橘红色，并有一条红色横条纹，体外卵巢轮廓清晰。雄鳝头大隆起明显，体背有色斑，在繁殖季节，腹部不膨大，但有血丝状斑纹，且生殖孔红肿，轻压腹部能挤出少量精液。
