复旦大学公共卫生学院专家发表的一项研究成果显示，H7N9病毒起源于华东地区。
最新一期的国际传染病领域著名期刊《临床感染病》(Clinical Infectious Diseases)，发表了复旦大学公共卫生学院青年教师熊成龙、张志杰等关于H7N9禽流感病毒基因的研究成果。他们以生物信息学为手段，对此次H7N9禽流感病毒基因进行研究和分析，找到了该病毒的起源和演化规律，即首次发现该病毒的2个最重要蛋白HA和NA，并非如此前中外学术界所普遍认为的“分别来源于中国和韩国禽类”，而是起源于华东地区的家禽或野鸟。
今年2月19日起，华东地区陆续出现系列流感样病例，3月31日，中国卫生与计划生育委员会通报确认感染病原为新型H7N9亚型禽流感病毒。对于该病毒的起源，中外学术界普遍认为来自中韩禽类，此说据于采集到的1株H7亚型HA(即H7N3病毒)来源于杭州鸭，而7株N9亚型NA(即H7N9病毒)则来源于韩国禽类。
熊成龙、张志杰研究团队认同中外学术界专家对HA来源的报道，但对NA来源则有异议。他们分析了全球共享的流感数据库中长度大于1000核苷酸的N9基因序列共321个NA序列，并由此推导出相应的蛋白质氨基酸序列，最终证实，H7N9禽流感病毒的最重要蛋白HA(N9基因)来源于中国江苏洪泽湖花脸鸭(即H11N9病毒株)，即NA蛋白并非来源于韩国。
该项研究还认为，杭州是H7N3病毒的分离地，也是本次流感流行的主要疫区之一，洪泽湖是中国第四大淡水湖，是水禽的主要栖息地之一，也是H11N9病毒的分离地，也就是说，从本次流感最初发生地、H7亚型HA贡献株分离地，以及H11N9病毒分离地点来看，均位于华东地区，从地理位置上来看，病毒株发生重组的可能性也远高于韩国株。
据介绍，这一发现将为准确推断流感病毒的起源与演化规律提供必要的理论依据，同时为进一步研究流感病毒的传播与流行规律，早期预警流感传播，进而采取积极有效的预防控制策略等有重要指导意义。
