小麦赤霉病菌在抽穗开花时入侵危害小穗，抽穗扬花期的雨日、雨量和相对湿度是决定病害流行的重要因素。该病害主要发生在穗期，引起穗腐，穗腐在小麦扬花期后出现。最初在颖壳上呈现边缘不清晰的水渍状褐色斑，渐扩大至整个小穗，小穗随后枯黄。湿度大时，病斑处产生粉红色胶状霉层。后期其上产生密集的黑色小颗粒(病菌子囊壳)。用手触摸，有突起感觉，不能抹去，籽粒干瘪并伴有白色至粉红色霉。小穗发病后扩展至穗轴，病部枯褐，使被害部以上小穗形成枯白穗。该病害防治的最佳时期为抽穗扬花期，如果天气预报扬花期多雨高湿，就应抓紧喷药，每亩可用50%多菌灵或70%甲基硫菌灵可湿性粉100克、30%烯·多悬浮剂80克或40%多·酮可湿粉100克。如扬花期遇到阴雨天气，5～7天后可再喷一次，以确保防治效果。
