清原县根据河道堤防多为砂土、土质瘠薄、处在高寒气候带的情况，选择了耐旱、耐瘠薄、耐寒的树种。
结合堤防的不同位置，合理选用不同树种。堤脚多选用根系发达、固土和抗冲刷作用比较好的树种，如杨树、柳树和榆树；堤防的迎水坡和背水坡选用能够涵养水分、有效防止水土流失的树种，如刺槐、紫穗槐、沙棘；坡面选择刺槐与沙棘间种，繁殖能力强，能够有效地防御人为因素及牲畜的破坏，两者互补，有效地起到了防护和固堤的双重效果。
目前，清河干流的汪家沟段、柴河干流的双榆树段、清河支流的吊弓沟河段护岸林已茂密成荫，并且有效地抵御了2001年的“8.2”、2005年的“8.13”洪水，实现了生态效益和社会效益双丰收。新栽种的树木一般要经过3?5年时间才能达到抵御洪水的作用，为保证所种植苗木的成活率，从1999年开始，清原县采取了木笼、石笼丁坝与生物防护相结合的方法，收到了极佳的护岸效果。从2006年开始，清原县与中国科学院沈阳生态研究所合作，在浑河建成试验段，该项目被国家命名为辽河“水专项”研究，并得到温家宝总理的亲笔批示，决定利用十五年时间研究和推广，总投资350亿元。
