大棚栽培的辣椒死棵现象大多数以根腐病、疫霉根腐病、茎基腐病、枯萎病等为主，青枯病发生较少。其实要想减少或避免上述病害的发生，菜农朋友就要从苗子做起，做好预防工作。
治疗辣椒死棵的有效办法：
1.选择无菌壮苗是关键。定植时如果主根或根尖有变褐色现象，“小老苗”等最好不要用，应该选择主根和须根黄白色、根尖乳白色、根毛密生的健壮幼苗为最佳。
2.选用良好的定植方式。应根据当地的土壤性质选择适宜的定植方式，如沙壤土选择畦栽为最好；粘种土壤应选择半坡式栽培较好；定植深度以幼苗土陀和地面相平为最佳。
3.要避免肥料伤根。菜农朋友虽说已经熟知蔬菜栽培施肥常识，但是往往在生长周期较长的茄科类栽培中，大量施用鸡粪，其施用鸡粪倘若腐熟不充分，便会在浇定植水后于土壤中发生二次发酵，并产生有害气体烧伤辣椒幼苗根系，导致感染病害。
4.将土壤进行药物处理。建议在幼苗定植前，将大棚土壤用征露（甲基硫菌灵）加福美双加可鲁巴三种药剂混合，每亩地各用1.5千克。具体操作：将上述药剂分两次使用，第一次将一半药剂施入定植沟内，第二次在幼苗培土时，均匀地将另一半撒在植株两侧。
5.合理浇水。多年生产经验证明，土壤水分过高是辣椒根部病害发生的最根本因素，因此合理浇水也是防治病菌侵染的关键措施之一，因此笔者建议：第一次定植水一定要透，利于幼苗增生新根，缩短缓苗期；缓苗后浇水以棚内土壤见干见湿为准，严禁田间有积水现象；早春发现有零星病株时，一定注意不要大水漫灌，否则会有毁棚的可能；雨季一定严禁有雨水灌入棚内。
6.控制棚温也可有效防治根部病害。大棚辣椒越冬栽培要尽量提高棚温和地温，越夏栽培一定要覆盖遮阳网，以降低光照强度，降低棚内温度和水分的蒸发量。
7.合理选择药剂防与治。建议菜农朋友从幼苗缓苗期便采取药剂预防，可选择征露800倍加精果净1000倍混合喷雾；或者选择可鲁巴800倍喷雾。另外，多数菜农朋友喷药时只是将药液均匀的喷施在辣椒的叶片区，往往忽略了茎秆部位，而上述病害的发生恰恰就是在辣椒的茎基部，所以防治辣椒死棵喷药重点在植株茎基部。
