一、颜色不同
番红花和藏红花虽然看上去都是红色的，颜色一样，实际上是有区别的。若是将番红花磨成粉末状会变为橙黄色，遇到水之后颜色会和原本的颜色不一样，且有味道，闻起来非常清香。而藏红花磨成粉末状后是橙红色的，沾水后会扩散，没有味道。
二、价格不同
虽然看起来外形是一样的，但市面上的价格是完全不同的。其中番红花比较普通，种植管理的面积广泛，因此价格上稍微要便宜些，一般每公斤在20元左右。而藏红花是一种很名贵的药材，价格昂贵，每公斤大概要在1000元左右，药店零售的还会更贵些。
三、功效不同
番红花能活血，缓解痛经，主要是女性朋友治疗痛经的时候使用。产后出现的恶露也可改善，有很好的效果。另外，也能用在跌打损伤的过程中，可改善肿胀。而藏红花能活血化瘀，解郁安神，凉血解毒，尤其对产后的郁结现现象能很好的改善，还适合治疗女性闭经现象。此外，两者的用量也完全不同，番红花的用量要远远高于藏红花。
