腐败病
腐败病一般会发生在发芽阶段，属于细菌；新芽在2至3个月时腐败病会尤为严重。先是从叶子的根部发生，被细菌侵入后会使其变成红褐色，然后叶子的尖部开始慢慢变黄，最后整片叶子都变黄；土壤下的根茎也会变成褐色，须根会由原来的白色变慢慢变成黑紫色。最后腐烂，至整株植物死亡。
防治方法
在撒种前，把种子用石灰水浸泡一会，捞出后在用清水洗净。在种植后引发腐败病，要及时把受病部分除掉，在用石灰粉进行消毒。还可用喷雾消毒液来进行预防与治疗。
腐烂病
紫番红花在腐烂后，叶子会先变黄，内里变黑，全部腐烂。但外表只会看到其叶子变化。腐烂病一般会在积水情况下，或是土壤里有害虫的情况下发生。
防治方法
在撒种前用石灰粉与土壤混合。对土壤下的害虫可用杀虫液浇到土壤上。
病毒病
病毒害会使紫番红花的叶子卷缩，叶子也的颜色也会减退、变形。
防治方法
在种植前要确认种子是否健康。然后用防虫液对其喷洒，以防其传染。
