一、黑斑病
刚长黑斑病的时候叶子会有黑褐色的斑点，斑点周围为黄色，然后慢慢蔓延到整片叶子，最后叶子会枯萎掉落。每年的3－5月是此病的高发期，可以喷洒波尔多液或者多灵液预防此病和控制其发展。
二、蜗牛
蜗牛喜欢吃黑毛石斛的叶子和茎，危害特别大，常常会把整个植株吃得一塌糊涂。平时要注意打扫枯枝败叶，保持干净卫生。可以用麸皮拌敌百虫放在蜗牛经常出没的地方投毒诱杀，也可以在栽种场地直接喷洒敌百虫等农药或者生石灰和盐水。
三、炭疽病
风雨能使炭疽病传播，通常它会以黑毛石斛的伤口侵入，所以此病一般发生在雨水多的时候。发病初期，黑毛石斛的茎叶会长出黑色的圆形小点，慢慢的小黑点上会出现桃红色的黏状物，最后叶子枯萎掉落。每年冬天及时清扫落叶枯枝，防止病菌贮藏过冬，喷洒多菌灵或甲基托布津。
四、煤污病
每年的3－5月也是煤污病的发病期，顾名思义发生此病虫害的时候，所有叶片表面都会蒙上一层像煤烟灰一样的黑色粉末，影响叶子的光合作用。防治办法：用多菌灵或乐果乳稀释喷洒。
五、菲盾蚧
菲盾蚧是一种常见的寄生虫，它常常会躲在黑毛石斛的叶子背面或边缘吸取叶汁，造成黑毛石斛叶子的枯萎掉落，没有控制好还会造成黑毛石斛的枯黄死亡，同时还会引发煤污病。在菲盾蚧长成壳后但数量不是很多的情况下，可以剪去已被病虫害的枝叶一起烧掉或者直接把它们捏死。5月的下旬是此虫的孵化期，当害虫数量多的时候可以喷洒乐果乳油或石硫合剂。
